Superman se ha ganado el corazón del mundo, pero provoca la ira de Lex Luthor, quien lo ve como una amenaza. Cuando Intergang intenta secuestrar al alcalde usando tecnología de Apokolips, Superman los detiene. La Liga de la Justicia envía los dispositivos a S.T.A.R. Labs, donde se confirma que sólo Luthor podría haberlos creado. Mientras tanto, Clark Kent mantiene su identidad en secreto frente a Lois Lane, lo que pone en riesgo su relación.
En el espacio, el astronauta Hank Henshaw y su equipo mueren tras un ataque causado por un Boom Tube. Un meteorito impacta en el Atlántico y libera a una criatura letal: Doomsday. El monstruo mata brutalmente a todo a su paso y derrota fácilmente a la Liga. Batman reconoce que solo Superman puede detenerlo.
Clark finalmente se revela como Superman ante Lois y parte a la batalla. Mientras lucha por Metrópolis, Lois lo apoda "Doomsday". Incluso Luthor, en un traje blindado, intenta detenerlo, pero fracasa. En un acto final, Superman mata a Doomsday, pero muere en brazos de Lois tras ser apuñalado.
El mundo llora su pérdida y se celebra un funeral de estado. Luego, Lois y Jimmy descubren que el ataúd de Superman está vacío, y una figura sobrevuela el cielo. En paralelo, cuatro figuras emergen: un clon joven escapa de Cadmus, el Dr. Irons forja una armadura con el símbolo de Superman, una figura críptica construye una fortaleza en el Ártico, y un Cyborg Superman llega desde el espacio.
