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Bowser Jr. est un Koopa qui ressemble beaucoup à son père, en particulier lorsqu'il était lui-même enfant. Les deux sont d'ailleurs souvent confondus. Bowser Jr. a un crâne vert et rond et ses yeux sont deux points noirs. Il porte ses cheveux avec un cercle en métal, donnant l'apparence d'une queue de cheval rouge avec 5 mèches. Ses sourcils ont deux mèches vers le haut et sont généralement froncés. Il possède une petite corne blanche à bord marron de chaque profil. Il a deux narines visibles. Il a un croc sur le profil gauche. Il a un corps de taille normale et porte deux bracelets en métal noir. Comme Bowser et les Terreurs de Bowser, il a des griffes aux bouts de ses 4 doigts et ses 3 orteils. Son ventre possède 4 plaques. Sa carapace, comme son père, est verte foncée avec des bords de piques marrons. Les piques sont disposées sur les bordures de sa carapace. Il possède 3 piques au centre et 2 sur les côtés, pour un total de 7 piques. Comme les autres Koopas, sa carapace à une bordure blanche. Comme Bowser, sa taille peut changer entre les jeux. Par exemple, dans Super Mario Galaxy, il est plus grand que Peach, comme vu avant la bataille finale entre Mario et Bowser. Bowser Jr. est gaucher, mais est droitier dans ses premières apparitions dans la série Mario Tennis. Ce fait pourrait être la raison pour laquelle il utilise la Junior-mobile depuis Ultra Smash. Super Mario Galaxy est le seul jeu où il a un croc sur le profil droit. Aussi, dans la série Super Smash Bros., ses cheveux et sourcils penchent plus sur le orange que le rouge
Following the incognito of the previous crossover, Tabuu threatens the multiverse, but this time it's worse, this time he's trying to make all the Earths collide and explode. Olimar's ship discovers the mystical being and tries to confront it, which is not a very good idea. Tabuu throws Olimar and the Pikmins too far and he lands in Metroid, where he meets Samus and she tells him that he meets a group of powerful warriors who can help stop this new great threat. Once everyone is reunited, they confront Tabuu. What they don't know is that when Mario and his friends are taken to Samus' ship, Wario and Waluigi sneak into it but this time they are discovered. The Wacky Bros confess everything they have been doing and Mario tells them that he could forgive them if they helped in this fight, which they accept. They apparently manage to defeat Tabuu, but what they fail to do is stop his plan in time. In the end, all the worlds end up coexisting in the same universe.
