En 1998, près de Raccoon City, l'équipe Bravo des S.T.A.R.S. disparaît en enquêtant sur des meurtres cannibales. L'équipe Alpha (Chris Redfield, Jill Valentine, Albert Wesker) est envoyée en renfort mais se réfugie dans un manoir infesté de zombies et de créatures créées par le virus T de l'Umbrella Corporation. Les survivants découvrent que leur capitaine, Wesker, est un traître travaillant pour Umbrella.