Luglio 1998. La città di Raccoon City è sconvolta da una serie di omicidi bizzarri e cannibalismo nelle zone boschive delle Montagne Arklay. Quando la SQUADRA BRAVO della S.T.A.R.S. scompare nel nulla durante l'indagine, viene inviata la SQUADRA ALPHA per il recupero.
Dopo un attacco brutale da parte di cani feroci e deformi, i sopravvissuti dell'Alpha Team — tra cui l'esperto tiratore Chris Redfield, la specialista in scasso Jill Valentine, il cinico Barry Burton e il misterioso capitano Albert Wesker — si rifugiano in un'imponente magione neoclassica: Villa Spencer.
Quello che sembrava un riparo si rivela una trappola mortale progettata dall'architetto George Trevor. Divisi e braccati da zombie, rettili mutanti (Hunter) e piante carnivore giganti, i membri della squadra devono risolvere enigmi letali per sbloccare le ali della villa.