Faz oito anos que Reed Richards, Susan Storm, Ben Grimm e Johnny Storm tiveram seus corpos atingidos por radiação cósmica, e depois disso suas vidas nunca mais foram as mesmas. Eles se tornaram o Quarteto Fantástico. Porém, existe uma história secreta jamais contada: como quase não sobreviveram aos primeiros dias após o acidente — sua verdadeira primeira aventura.
Semanas após o incidente, Reed trabalha incansavelmente para encontrar uma cura que reverta os efeitos da radiação, principalmente em Ben. Quando suas pesquisas chegam a um beco sem saída, ele recorre a um antigo amigo da faculdade, o doutor Herbert Wyndham, conhecido por suas controversas pesquisas sobre evolução genética.
O que Reed não sabia era que Wyndham já observava o grupo, vendo em seus DNAs únicos a chance perfeita para avançar em seus experimentos. Ele leva Reed e os outros à Contra-Terra, um mundo artificial criado para servir de laboratório vivo.
Enquanto Reed se maravilha com os avanços científicos e Ben encontra um lugar onde não é tratado como monstro, Susan e Johnny desconfiam das reais intenções de Wyndham, causando um racha no grupo. Não demora para que todos percebam a verdade: Wyndham, o Alto Evolucionário, planeja expandir seus experimentos, alterando o gene de toda a vida na Terra usando o DNA do quarteto.
Diante dessa ameaça, os quatro se unem pela primeira vez, combinando seus poderes para deter Wyndham, dando origem ao Quarteto Fantástico.