Tijdens een doodgewone schooldag ziet Sam tot zijn verbijstering zijn leraar pal voor zijn ogen verdwijnen. Zomaar ineens weg! Algauw blijkt dat iedereen ouder dan vijftien jaar op hetzelfde moment is verdwenen. Bovendien is er een ondoordringbare barrière rond de stad opgetrokken, waardoor er geen contact meer mogelijk is met de buitenwereld. Er breekt een enorme chaos uit. Net buiten de stad trekt Caine de leiding naar zich toe en daarna ook over de stad. Gaandeweg voert hij met een aantal volgelingen een waar schrikbewind. Honger, geweld en een plaag bizarre insecten zijn maar een paar van de beproevingen die de overlevenden in Perdido Beach moeten doorstaan. Sommigen gaan de strijd aan met Caine en de andere freaks, gemuteerde kinderen die voor dood en verderf zorgen. Maar de Duisternis lijkt onverslaanbaar...
