Mesmo com o fracasso do MechaGodzilla, os humanos não se contentaram e decidiram que usariam do DNA de Godzilla para criar um Titã que sirva aos seus propósitos. Ignorando qualquer problema que poderia ocorrer, os cientistas fundem o DNA com plantas e acabam por criar Biollante, um Titã completamente fora de controle e que quer transformar a cidade num cenário da pré-história. Godzilla pressente seu inimigo e parte em uma batalha mortal para impedir suas intenções destrutivas, tendo como ajuda um aliado chamado Anguirus.
