Henry Walton Jones Junior naît le 1er juillet 1899 à Princeton dans le New Jersey. Il est le fils d'Anna et Henry Jones. Son père, d'origine écossaise, est professeur de littérature médiévale, diplômé de l'université d'Oxford. Ils ont un chien, un jeune Malamute de l’Alaska, baptisé Indiana. En 1905, Henry Junior décide d'adopter le nom de son chien pour se différencier de son père. Dès 1908, Indiana suit son père qui donne des conférences à travers le monde. Ces voyages incessants ne lui permettent pas d'être inscrit à l'école et il est donc suivi par Helen Seymour, une préceptrice. C'est en Égypte qu'Indiana Jones découvre l'archéologie. Pendant que son père donne une conférence à l'université du Caire, lui et Miss Seymour visitent les pyramides. Estimant ne pas être assez bien payé, le guide qui les accompagne vole leurs chameaux et les abandonne sur place. Esseulés et ne sachant que faire, un visage familier de la préceptrice apparaît alors, c'est T.E. Lawrence. Ce dernier les emmènent dans un secteur proche de la Vallée des Rois où un de ses amis archéologue mène des fouilles. Indi assiste et participe à l'ouverture d'un tombeau sur lequel pèse une malédiction. Cette première expérience est la source de la vocation d'Indiana Jones