10 anos após a aposentadoria como Batman, Bruce Wayne encontra uma Gotham City corrompida por crime e assassinatos cometidos pelos cruéis terrorristas conhecidos como mutantes, liderados por um misterioso líder assassino. O herói encontra até mesmo um mundo sem heróis que só o Superman age. O Cavaleiro das trevas acha também um mundo corrompido pela injustiça, e precisará deter o Líder mutante e um mais louco Coringa e enfrentar o Homem de Aço, para impor sua lei novamente a sociedade.